Code 3 ist ein Geheimcode der Sternenflotte aus dem 23. Jahrhundert.
Als sich die Enterprise 2267 in der Nähe der Romulanischen Neutralen Zone befindet, um die Sternenflotte von der Ursache der Situation auf Gamma Hydra zu informieren, wo Kolonisten der Föderation einen raschen Alterungstod sterben, weist Captain Kirk Lieutenant Nyota Uhura an, Code 2 zu benutzen. Auf den Hinweis, dass der Code geknackt ist, entscheidet sich der ebenfalls unter massiver Alterung befindliche Kirk für Code 3.
Später verwendet er Code 2 dennoch, um die Romulaner mit einem Corbomit-Manöver abzuschütteln. (TOS: Wie schnell die Zeit vergeht)