Der Große Krieg ist ein bewaffneter Konflikt zwischen den Kyrianern und Vaskanern im 24. Jahrhundert. Er beginnt 2374 und endet mit großen Verlusten der Kyrianer. Anschließend werden die Kyrianer 700 Jahre lang gegenüber den Vaskanern benachteiligt.
Lange glauben die Kyrianer, dass die Vaskaner die Aggressoren im Großen Krieg sind. Nach dieser Geschichte, schließt Botschafter Daleth ein Abkommen mit dem Kriegsschiff Voyager. Diese greift daraufhin die Kyrianer an und erhält im Gegenzug die Koordinaten eines zyklischen Wurmlochs. Nach der Exekution des kyrianischen Anführers Tedran und dem Einsatz von Bio-Waffen gegen die kyrianische Zivilbevölkerung, können diese den Vaskanern nicht mehr standhalten.
Im 31. Jahrhundert wird in den Ruinen von Kesef das MHN-Backup-Modul entdeckt. Der Doktor erzählt daraufhin eine abweichende Geschichte des Großen Krieges. Demnach handelte die Voyager medizinische Versorgungsgüter gegen Dilithium, als sie von Tedrans Streitkräften angegriffen wird. Tedran wird von Daleth erschossen, nachdem er Geiseln genommen hatte. Wenig später beginnt der Krieg zwischen Vaskanern und Kyrianern und die Voyager muss sich vor einer kyrianischen Flotte von neun Raumschiffen zurückziehen.
Die Vaskaner akzeptieren niemals die kyrianische Version der Geschichte und nachdem die Version des Doktors bekannt wird, brechen Rassenunruhen aus. Jedoch können der Doktor und der kyrianische Historiker Quarren den Grundstein für eine Versöhnung der Völker legen und eine neue Ära beginnt. (VOY: Der Zeitzeuge)