Spezies 6339 ist eine Spezies aus dem Delta-Quadranten. Ihr Ursprung liegt im Raumgitter 124, Octant 22-theta. Der Föderation ist nur ihre Borgbezeichnung bekannt.
Spezies 6339 hat eine dunkle Haut und einen ausgeprägten Schädel. Aus der Stirn ragen zwei ca. 10 cm lange Hornfortsätze. Die Raumfahrer der Spezies tragen fremdartige Kleidung, die zum Teil fluoresziert.
Im Jahr 2371 trifft die Spezies 6339 erstmalig auf die Borg. Seitdem werden von den Borg 11 Milliarden Individuen assimiliert und damit die Art fast vollständig ausgerottet. Die letzten Überlebenden sind im ganzen Gebiet auf einzelnen Schiffen verstreut.
Im Jahr 2375 entwickelt Spezies 6339 ein Virus, das das Vinculum auf den Borg-Schiffen angreifen und damit das Borg-Schiff zerstören soll. Das Virus wird 13 Mitgliedern dieser Rasse injiziert. Diese lassen sich anschließend von den Borg assimilieren, damit das Virus an Bord des Borg-Schiffes gelangen kann. Der Plan ist, dass durch den zerstörten Kubus weitere Schiffe in Reichweite des infizierten Vinculums gelockt werden sollen.
Der Plan schlägt jedoch fehl, als Seven of Nine an Bord der USS Voyager durch das Vinculum beeinflusst wird. Um Seven vor Gehirnschäden zu schützen, nimmt die Voyager das Vinculum an Bord und versucht es zu deaktivieren. Spezies 6339 erfährt von dem Vorhaben der Voyager und greift sie an, um die Zerstörung des Vinculums zu verhindern.
Über die Technologie der Spezies 6339 ist nicht viel bekannt. Ihre wenigen noch existierenden Schiffe sind allerdings wohl relativ schwer bewaffnet. (VOY: Das Vinculum)