Trilithium wird zur Produktion von Waffen verwendet. Meist wird es als Sprengstoff eingesetzt, ist jedoch auch hoch giftig. Trilithium lässt sich aus Dilithium oder Paralithium herstellen. (TNG: In der Hand von Terroristen; VOY: Das Hochsicherheitsgefängnis)
Die Romulaner forschen im 24. Jahrhundert an einer waffenmäßigen Verwendung des Trilithiums, scheiteren jedoch daran das Trilithium stabil zu halten.
Dagegen schafft es Dr. Tolian Soran 2371 Trilithium-Torpedos herzustellen. Er verwendet diese, um die Sonne des Amargosa-Systems zu zerstören. Das ist möglich, da Trilithium nukleare Reaktionen verhindert und somit die Kernfusion innerhalb einer Sonne stoppt. Die Duras-Schwestern Lursa und B'Etor wollen diese Waffe verwenden um das Klingonische Reich zurückzuerobern. (Star Trek: Treffen der Generationen)
2373 benutzt Open Sky Sprengstoff auf Basis von aus Paralithium hergestellten Trilithium, um einen Bombenanschlag auf das Laktivianische Erholungszentrum zu verüben. Da die USS Voyager die einzige Dilithiumquelle im System ist verdächtigt die Regierung von Akritiri die Crew der Voyager des Terrorismus. (VOY: Das Hochsicherheitsgefängnis)
Trilithiumharz fällt als Nebenprodukt der Warpantriebe auf Föderationschiffen an. (TNG: In der Hand von Terroristen)