Una alerta amarilla es el segundo estado de alerta más alto en las naves y bases estelares de la Flota Estelar, el estado inmediatamente inferior al de alerta roja. Indica un estado mayor de alerta ante posibles situaciones de crisis.
En este estado, se levantan los escudos defensivos y/o los escudos deflectores se ponen a máxima potencia, pero no se activan los sistemas de armas. (TOS: "A Taste of Armageddon", "The Lights of Zetar"; Star Trek II: The Wrath of Khan, Star Trek IV: The Voyage Home)
Dependiendo de la situación, el capitán puede ordenar que vaya acompañada de una reducción de la velocidad ante cualquier posible amenaza. (TAS: "The Pirates of Orion"; Star Trek IV: The Voyage Home)
El oficial al mando puede activar manualmente una alerta amarilla para preparar una táctica o ante una situación ambiental peligrosa. La activación puede ser automática al detectarse naves espaciales desconocidas u hostiles, o al detectarse ciertos fallos de funcionamiento en los sistemas. Si la situación se agrava, el comandante o el ordenador principal ordena pasar a alerta roja. (TNG: "Yesterday's Enterprise")