Si primer combate fue en la Segunda Batalla de Deep Space 9, cuando la USS Defiant y el IKS Rotarran lucharon contra las naves del Dominio y Cardassianas en el ataque a la Estacion Espacial, y evacuando a todos los oficiales de la alianza cuando se retirraron. Mientras esto pasaba, una flota conjunta ataco y destruyo los astilleros del Dominio en Torros III, debilitando enormemente su principal centro de infraestructura. (DS9: Call to Arms)
Flota de las 3 naciones de la Alianza parten de DS9 hacia Cardassia Prime
Durante meses las fuerzas de la Alianza habian tenido duros combates con el Dominio, siendo la Batalla de Tyra el punto algido, cuando una flota de 112 naves despues de la dura batalla, se decio hacer una contra ofensiva, la Operación Retorno.
La Flota Estelar logro consegur los permisos y las fuerzas para llevarla al cabo, pero las Fuerzas de Defensa Klingon estaban dudosas pues esto significaria dar una conciderable parte de la defensa klingon al opertivo, apesar que El General Martok y Worf si querian ayudar, debian convencer al Canciller Gowron. Cuando la operacion se llevo al cabo de forma precipitada ante el avence del Dominio, la Flota Estelar resistio horas el ataque hasta que la fuerza klingon llego para terminar de destruir la linea defensiva del Dominio.
Ingreso Romulano[]
Los romulanos habian firmado un tratado de no agresion con el Dominio, en especial gracias al fracaso del Tal Shiar en la Batalla de la Nebulosa Omarion. Gracias a este tratado, el Dominio atacaba posiciones de la Federacion y Klingon en la frontera romulana. El Comando de la Flota Estelar autorizo al Capitan Benjamin Sisko ha hacer una treta para hacer que los romulanos entren en la guerra, usando un tubo de informacion cardassiano falsificado donde dice que el Dominio atacaria a Romulus, con ayuda de un falsificador criminal y Elim Garak, usando al senador romulano Pro-Dominio Vreenak para esto, pero el se dio cuenta del engaño y antes de llegar al Imperio su nave exploto, fue Garak que puso una bomba en su nave para hacerlo parecer un ataque del Dominio.
Los romulanos creyeron que el Senador descubrio la verdad y fue callado por el Dominio, y en cuestion de horas ingreso a la Guerra atacando mas de una docena de puestos enemigos y ayudando en la Liberacion de Benzar.
La Alianza[]
Naves de la Alianza avanzan a Cardassia
La primera gran ofensiva aliada fue en la Primera Batalla de Chin´toka, cuando 60 naves de las 3 potencias tomaron por asalto el Sistema Chin'toka, al destruir su guarnicion Jem'Hadar y acabar con los centenares de plataformas orbitales cardassianas. Su victoria ayudo a otras batallas del frente de guerra. (DS9: Tears of the Prophets)
Tuvieron un fuerte reves en la Segunda Batalla de Chin´toka, cuando una flota de 212 naves conjuntas fueron destruidas excepto una, cuando los Breen atacaron con su arma de energia, perdiendo el sistema y dejando la defensa a los klingon pues sus naves lograron hacerlos inmunes al arma, mientras la federacion y romulanos modificaban sus naves. (DS9: The Changing Face of Evil)
Pero el maximo punto de esta alianza fue en la Batalla de Cardassia Prime, cuando una enorme fuerza de casi un millar de naves de la Alianza asaltaron el Sistema Natal de la Unión Cardassiana, donde en el proceso las fuerzas cardassianas se rebelaron contra el Dominio y se juntaron con los aliados. Despues de duros combates con las naves Jem'Hadar, Breen y plataformas orbitales, la flota de la Alianza se preparaba para un asalto final sobre el mismo planeta de Cardassia donde estimaban enormes perdidas, afortunadamente la captura de la Cambiante Hembra detuvo las hostilidades. (DS9: What You Leave Behind)
Tanto la República Bajorana como la Unión Cardassiana fueron signatarias del Tratado de Bajor, por lo que es posible que se unieran a la Alianza de la Federación para firmar el tratado de paz. Según los nuevos Artículos de la Federación y la novela gráfica The Gorn Crisis, la Hegemonía Gorn también era parte de la Alianza, aunque solo proporcionaba apoyo material y reparaciones a los barcos aliados. Sin embargo, el manual del juego de Star Trek: Bridge Commander afirma que los Gorn fueron aliados del Dominio en la guerra.