On peut également considérer que les vaisseaux andoriens, tellarites, terriens, vulcains et des autres membres sont également intégrés à la flotte de la Fédération à compter l'admission de ces puissances à la Fédération.
ATL: Ces vaisseaux ont été vus ou nommés durant la période d'événements "Alternatifs" de l'Enterprise NX-01 au 26ème siècle.
ATL: Ces vaisseaux ont été vus ou nommés durant la période d'événements "Alternatifs" de l'USS Enterprise NCC-1701-D au 24ème siècle.
ATL: Ces vaisseaux ont été vus ou nommés durant la période d'événements "Alternatifs" de l'USS Voyager NCC-74656 au 24ème siècle.
DIS (+ SHO): Ces vaisseaux ont été vus ou nommés durant la période des événements de l'USS Discovery NCC-1031 en 2257-58 et 3189.
KTL: Ces vaisseaux ont été vus ou nommés durant la période des événements connus de la ligne temporelle Kelvin entre 2233 et 2263.
Vaisseaux fictifs
Il ne fut pas clarifié, si l'USS Kobayashi Maru ECS-1022 (KTL) était un vaisseau fictif pour l'exercice de simulation ou s'il a existé et que ce nom fut utilisé pour la simulation.
Le vaisseau de guerre Voyager était un vaisseau fictif basé sur l'USS Voyager par les Kyriens en 3074.
L'USS Vortex et l'USS Voyeur étaient des vaisseaux fictifs créés par Le Docteur pour le programme holographique "Photons, libérez-vous".
L'USS Stamets NCC-1019 était un vaisseau fictif créé par l'imagination de Paul Stamets lors d'une imprégnation dans le réseau mycélien.
L'USS Ravenous était un vaisseau fictif créé pour un message publicitaire d'informations sur les tribules.
L'USS San Clemente est considéré comme inexistant dans le programme holographique Boimler 7, mais il est possible qu'il existe et que ce soit le scénario qui nie son existence.
Il ne fut pas clarifié si l'USS MacDuff NCC-1877 était un vaisseau fictif dans le programme du centre de détention cardassien ou s'il a existé et que ce nom fut utilisé pour le programme holographique.
L'USS Voyager NCC-74656-D était un vaisseau fictif imaginé par Beckett Mariner afin de pouvoir accéder à la fête de Starfleet.
L'USS Dauntless NX-01-A était un vaisseau extra-terrestre déguisé en vaisseau de Starfleet.
Incertitudes
(1) - Les vaisseaux USGS Powell et W.E.B. DuBois, leur affiliation n'est pas claire, mais le fait qu'ils soient nommés en l'honneur d'un Humain, en fait des vaisseaux probables de la Terre ou de la Fédération. USGS signifiant dans le monde réel "US Geological Survey".
(2) - Le SS Xhosa bien que construit par la Fédération sur les chantiers de La Lune semble ne pas être sous autorité de celle-ci, il est possible que cette classe Antares ait vu ses vaisseaux revendus à des civils non-affiliés. SS La Sirena NAR-93131 est un vaisseau civil terrien.
(4) - L'USS Clavyn a été remplacé lors de la remasterisation de TNG ("The Eye of the Beholder") par l'USS Clayton et les deux versions sont irréconciliables.
(5) - Il est évident que si l'USS Enterprise NCC-1701-J existe les vaisseaux USS Enterprise NCC-1701-F, -G, -H, et -I ont existé. Même raisonnement pour l'USS Excalibur NCC-1664-M, les vaisseaux USS Excalibur NCC-1664, -A, -B, etc. Ainsi que pour l'USS Tikhov NCC-1067-M, les vaisseaux USS Tikhov NCC-1067, -A, -B, etc. Ainsi que pour l'USS Voyager NCC-74656-J, les vaisseaux USS Voyager NCC-74656-A, -B, -C, etc. ont existé.
(9) - Si la série Discovery se passe bien dans la ligne temporelle première, il est possible que l'USS Saratoga NCC-1887 des films et l'USS Saratoga de DIS soient un seul et même vaisseau puisque la classe Miranda existe dans les années 2260 sans date précise de la mise en service.
(10) - Les vaisseaux USS Albert Einstein et USS John F. Kennedy possèdent la même immatriculation: NCC-85183.
(11) - Les vaisseaux USS Elmer Fudd, USS Mustang et USS Puget Sound possèdent la même immatriculation: NCC-85343.
(12) - Les vaisseaux USS Minnow et USS Tranquillity Base possèdent la même immatriculation: NCC-19585.