コンピュータ科学（computer science）は、理論、アルゴリズム、設計、情報処理システムのアーキテクチャに関する科学の一分野である。これらの概念は全ての宇宙艦隊コンピュータとセンサー・システムの基礎である。コンピュータ科学はサイバネティクスとロボティクスの分野を包括している。
2266年、M-5コンピュータはコンピュータ科学の革命だと考えられていた。（TOS:恐怖のコンピューターM-5）
2364年、データ少佐は彼が発見したUSSスターゲイザーのメイン・コンピュータの記録とジャン・リュック・ピカード大佐の個人日誌との間のチェックサムの不一致を説明した。ウィリアム・Ｔ・ライカー中佐は「私はコンピュータ科学の授業を受けたくないよ、データ」と言って彼の話を遮った。（TNG:復讐のフェレンギ星人）
カート・マンドルは人工知能等のコンピュータ科学の上級学位を持っていた。（TNG:神に似た人々）