Deuterium, ook wel zwaar water genoemd, is een isotoop van waterstof, bestaande uit één proton, één neutron, en een elektron die eromheen cirkelt. De meeste waterstofmoleculen hebben geen neutron(en). Natuurlijk voorkomend water is in minder dan 1% van de gevallen deuterium. Deuterium vormt samen met de antistof anti-deuterium de basisbrandstof bij stof-antistof reacties, zoals die in de kern van een Warp reactor. Het werd in grote hoeveelheden opgeslagen in sterrenschepen om die reden. (TNG: "Heart of Glory", "Night Terrors," enz...)
Deuterium werd onder andere gewonnen door bussard collectoren te gebruiken. Een Bussard collector werd gebruikt om waterstof en andere gassen te verzamelen, waaronder Deuterium. Toch was het zo dat de USS Voyager regelmatig op andere manieren aan deuterium moest zien te komen. (VOY: "Demons")
- De reden hiervoor is onbekend. Het zou kunnen zijn dat de bussard collectoren niet (goed) werkten, de collectoren niet kunnen voorzien in alle behoefte aan deuterium, of dat Voyager vaak meer deuterium gebruikte dan opgeslagen kon worden, doordat ze constant op warp snelheid reisden.