De Federatie bevat vele kolonies van de verschillende leden.
Aarde kolonies[]
Deze kolonies werden door de verschillende overheden van de Aarde of de Verenigde Aarde opgericht. Vele van hen zijn ouder dan de Federatie.
Onafhankelijke kolonies[]
Deze kolonies hebben de onafhankelijk uitgeroepen en enkele zijn zelfs in het geheim opgericht.
- Alpha Centauri kolonie (Alpha Centauri systeem, Federatie oprichter)
- Dorvan V kolonie (Dorvan V)
- Genome kolonie (Moab IV)
- Tau Cygna V kolonie (Tau Cygna V)
Verloren kolonies[]
Deze kolonies werden kwijtgeraakt tijdens de chaos van het einde van de 21e eeuw en de vroege 22e eeuw.
- Bringloid V kolonie (Bringloid V, verlaten)
- Mariposa kolonie (NB2323)
- Terra 10 kolonie (Terra 10, verlaten)
- Terra Nova kolonie (Terra Nova)
Andere kolonies[]
Dit zijn de kolonies van de Aarde die afhankelijk voorraden zijn van de Aarde of de Federatie voor.
- Caldos kolonie (Caldos II)
- Deneva kolonie (Deneva)
- Aarde kolonie 2
- Aarde kolonie 5 (Alpha V)
- Lunar kolonies (Luna)
- Lunar 1 kolonie
- Orpheus mijnkolonie (mogelijk verlaten)
- Mars kolonies (Mars)
- New Berlin kolonie
- New France kolonie (Bajor sector)
- New Paris kolonies
- New Providence kolonie (Jouret IV, verwoest)
- Proxima kolonie (Alpha Centauri systeem)
- Omicron Theta kolonie (Omicron Theta, verwoest)
- Signia Minor kolonie
- Strnad kolonie (Strnad systeem)
- Vega kolonie (Vega systeem)
Vulcan kolonies[]
Deze kolonies werden door het Vulcan Hoge commando. Vele van hen zijn ouder dan de Federatie.
Andere Federatie kolonies[]
Vele van deze kolonies werden opgericht door de Federatie. Vele verschillende leden van de Federatie leven samen in een kolonie.
- Ajilon prime kolonie (Ajilon prime)
- Aldebaran kolonie (Aldebaran systeem)
- Archanis IV kolonie (Archanis IV)
- Archer IV kolonie (Archer IV)
- Arvada III kolonie (Arvada III)
- Barisa prime kolonie (Barisa prime)
- Benecia kolonie (Benecia)
- Beta VI kolonie (Beta VI)
- Campor kolonie (Campor III)
- Cerberus kolonie (Cerberus)
- Cestus III kolonie (Cestus III)
- Coltar IV kolonie (Coltar IV)
- Delta Rana IV kolonie (Delta Rana IV)
- Galen IV kolonie (Galen IV)
- Gamma Hydra IV kolonie (Gamma Hydra IV)
- Gault kolonie (Gault)
- Hanolan kolonie
- Iadara kolonie
- Ivor prime kolonie (Ivor prime, verwoest)
- Izar kolonie (Izar systeem)
- Janus VI kolonie (Janus VI)
- Juhraya kolonie (Juhraya, overgenomen door de Cardassian unie)
- Kessik IV kolonie (Kessik IV)
- Manzar kolonie (Sector 441)
- Melona kolonie
- MS 1 kolonie
- Nehru kolonie (Bajor sector)
- Norpin kolonie (Norpin V)
- Omicron kolonie (Omicron Ceti III, verlaten)
- Ophiucus III kolonie (Ophiucus III)
- Sigma III kolonie (Quadra Sigma III)
- Taranko kolonie
- Tantalus kolonie (Tantalus V, strafkolonie)
- Tendara kolonie
- Tarsus IV kolonie (Tarsus IV)
- Triacus kolonie
- Turkana IV kolonie (Turkana IV, mislukt)