涵蓋多條平行時間線的信息
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| 詹姆斯•柯克 2371年 | |
| 性別： | 男性 |
| 種族： | 人類 |
| 隸屬於： | 星際聯邦 星際艦隊 |
| 軍銜： | 上校 |
| 職務： | 星際艦隊軍官 |
| 編號： | SC937-0176CEC |
| 狀態： | 已故（2371年） |
| 出生： | 2233年3月22日 地球，美利堅合眾國，愛荷華州 |
| 死亡： | 2371年 Veridia 3號星 |
| 父親： | 喬治•柯克 |
| 母親： | 薇諾娜•柯克 |
| 兄弟姊妹： | 兄弟：喬治•塞繆爾•柯克 |
| 婚姻狀況： | 喪妻 |
| 子女： | 戴維•馬庫斯 |
| 其他親戚： | 格洛（岳父） 奧蘭萊•柯克（嫂子） 彼得•柯克（侄子） 姓名不詳的2位侄子 提比略•柯克（祖父） 詹姆斯（外祖父） |
| 演員： | 威廉•夏特納 |
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| 詹姆斯•T•柯克，2265年 | |
- 在鏡像宇宙中的版本參見 詹姆斯·T·柯克（鏡像宇宙）。"不要讓他們晉升你。不要讓他們調任你。不要讓他們做任何讓你離開那艘星艦艦橋的事，因為當你在那時，你可以驚天動地。"——詹姆斯·T·柯克，2371年 （《星際迷航：斗轉星移》）
詹姆斯·提比略·柯克（James Tiberius Kirk）是23世紀星際艦隊的一名人類男性軍官。他被公認為是星際艦隊歷史上最著名且貢獻最大的星艦艦長之一。作為憲法級星艦進取號和進取號-A的指揮官，柯克以一名探索者、軍官、時空旅行者和外交官的身份為星際聯邦而工作。
他的事跡是24世紀的星際艦隊學員在學習早期艦隊歷史中的必讀內容（《星際迷航：斗轉星移》；航海家號：《Q2》），包括違反最高指導原則去挽救瀕臨滅絕的菲洛斯人，拯救巴贊和Chenari人，以及打破進行最多第一次接觸的記錄。（航海家號：《Q2》）這個記錄直到24世紀70年代才被凱薩琳·珍妮薇艦長所打破。她是探索德爾塔象限的第一位聯邦艦長。（航海家號：《Friendship One》）
早年[]
詹姆斯·提比略·柯克（」吉姆「）是十九世紀的一名美國拓荒者的後裔。（原初：《Spectre of the Gun》）
他在2233年3月22日出生於地球上的美國愛荷華州。（原初：《The Deadly Years》；《星際迷航：搶救未來》；《星際迷航：終極先鋒》；進取號：《In a Mirror, Darkly, Part II》）他的父母是喬治·柯克和薇諾娜·柯克。他的名字」詹姆斯「來自於外祖父，而」提比略「來自於祖父。（動畫系列：《Bem》；《星際迷航：未來之城》；《星際迷航》）他還有一個哥哥，喬治·塞繆爾·柯克（原初：《What Are Little Girls Made Of?》，《Operation -- Annihilate!》）。
在2246年，柯克正住在塔爾蘇斯IV號星上，這座有八千名居民的殖民地發生了饑荒。科多斯總督信仰舊時的優生學而且沒有發現即將趕來的援助船。於是他殺死了他認為最不可能倖存的四千名殖民者來挽回局面。十三歲的柯克是大屠殺的九名目擊者之一。（原初：《The Conscience of the King》）
星際艦隊學院[]
芬尼根，2252年
在2252年，柯克在舊金山的星艦學院開始了為期五年的學員時代。（原初：《Shore Leave》，《The Apple》）他後來承認他的父親是他加入星際艦隊的動力。（《星際迷航》）
在學院的第一年，一名叫芬尼根的愛爾蘭惡霸注意到了柯克。那些高年級學員在課餘時間常常欺辱「小吉米」。十五年後，當柯克在一顆上岸度假星球上遇見幻象時，他立即想到了芬尼根並狠狠地揍了他。（原初：《Shore Leave》）
在柯克還是學員時，他與班傑明·芬尼上尉就結為了朋友，這段友誼一直持續到他們在聯邦星艦共和國號服役時。他們當初的關係非常好，芬尼甚至把他的女兒起名為Jame Finney。（原初：《Court Martial》）
柯克以一名學員的身份去阿克薩納星參加了一次成功的和平任務，為此他獲得了星際艦隊指揮部授予的阿克薩納和平任務棕櫚葉獎章。（原初：《Court Martial》，《Whom Gods Destroy》）
柯克在學院還認識了一個人，他將再次出現在柯克日後的星際艦隊生涯中。他是一名出色的老師，叫做約翰·吉爾，他還是一位著名的歷史學教授和文化觀察員。（原初：《Patterns of Force》）柯克也研究了伊扎的加斯艦長的事跡，特別是他在阿克薩納的出色任務。加斯艦長也成為了柯克敬仰的英雄。（原初：《Whom Gods Destroy》）同時，柯克還想見一見被稱為「考古醫學的巴斯德」的Roger Korby醫生。（原初：《What Are Little Girls Made Of?》）他還從克林貢將軍Korrd那裡學到了軍事戰略。（《星際迷航：終極先鋒》）他還在星艦學院參與了Nomad探測器的試飛。（原初：《The Changeling》）
柯克還訓練過應對超負荷電路。（原初：《Dagger of the Mind》）
在訓練指揮技能期間，柯克接受了小林丸號測試。這個測試旨在評價學生在面對必敗的戰鬥或救援行動時的反應。柯克不接受這種失敗，在他第三次參加測試時，他偷偷修改了模擬程序並因此成為了學院歷史上唯一通過此項測試的學生。而且他因具有創造性的思維而受到了表彰。（《星際迷航：可汗之怒》）
低級軍官[]
柯克正式入役為一名星際艦隊軍官，服役編號SC937-0176CEC。（原初：《Court Martial》）
23世紀五十年代，就在他認識芬尼上尉幾年後，他被晉升為少尉，在共和國號上與本·芬尼上尉並肩作戰。但柯克記錄了芬尼上尉的一個重大失誤，導致芬尼收到處分並失去了繼續晉升的機會。(原初：《Court Martial》
在2255年，柯克升為上尉。這名年輕的上尉在Neural星球上執行了他的第一次行星調查任務。柯克認識了這顆星球的原住民山地人泰里並和他成為了好朋友。柯克在報告中將之描述為一種原始但正蓬勃發展的文明。柯克認為應當對這顆星球不加以干涉並得到了星際艦隊的批准。（原初：《A Private Little War》）
在2257年，他在加洛維特(Garrovick)艦長手下服役。柯克第一次的深空任務也是在加洛維特的聯邦星艦法拉古特號上執行的。他被分配到相位炮控制室擔任相位炮手。（原初：《Obsession》）
2257年，法拉古特號在第谷IV號星附近遭遇了dikironium雲團生命體。它殺死了加洛維特艦長在內的兩百名船員。柯克在法拉古特號的記錄磁帶中堅稱自己該為這次災難負責，因為他由於失去意識而沒能及時向那個生物開火。但法拉古特號的大副則說，「柯克上尉是一名十分英勇的年輕軍官」。（原初：《Obsession》）
在23世紀50年代，柯克上尉在星際艦隊學院擔任過一段時間的教授。
五年任務[]
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聯邦星艦進取號（NCC-1701）
柯克在23世紀50年代末60年代初的星際艦隊服役時得到了晉升，軍銜迅速提高。
在2265年，柯克32歲時，他從克里斯多弗·派克上校手中接管了聯邦星艦進取號（USS Enterprise NCC-1701）。（原初：《The Menagerie, Part I》）柯克認為是自己的父親喬治·柯克鼓勵他加入的星際艦隊，後者至少活到了柯克成為進取號的艦長的時候，並經常以他為驕傲。（《星際迷航》）
此外，柯克還結識了派克指揮期間的科學官史波克，一個瓦肯人。他成為了進取號的大副。（原初：《Where No Man Has Gone Before》）
柯克還請求加里·米切爾中校和他一起執行第一個外遣任務（原初：《Where No Man Has Gone Before》），以及指揮著本·芬尼。（原初：《Court Martial》）
在2266年，柯克曾住在12號甲板上。後來，他搬到了5號甲板的「3F 121」房間裡。（原初：《Mudd's Women》，《Journey to Babel》）
第一年[]
進取號，2265年
柯克在2265年到2270年指揮的五年任務使他成為太空探索的傳奇人物。（航海家號：《Q2》）除了「探索未知的新世界，尋找新生命和新文明」以外，他還接受了調查類星體等常規任務。（原初：《The Corbomite Maneuver》，《The Galileo Seven》，《Return to Tomorrow》）
柯克和米切爾不止一次共同參加了外遣任務，其中包括在Dimorus星的一次。他們在那裡遇到了會射出毒鏢的類似齧齒動物的生物，米切爾救了柯克的命，但自己也險些喪生。（原初：《Where No Man Has Gone Before》）
他們後來訪問了Deneb IV，在那裡至少有三次，米切爾能夠與當地人進行長時間的心靈感應交流，理解率達到80%及以上。一天晚上，米切爾與一名女性土著的對話對他產生了不良影響。柯克後來說，他自從那時開始就一直很擔心米切爾。作為雙關語，柯克稱這個女孩為「新星」。（原初：《Where No Man Has Gone Before》）
柯克面對未知
在Aldebaron殖民地停留後，進取號嘗試確定星艦勇敢號的下落。在發現了勇敢號的災難記錄儀後，進取號繼續前進，並第一次遇到了銀河系邊緣的大屏障。它解釋了早期飛船探索銀河系邊緣時發生的災難。進取號沒能突破大屏障，甚至差點沒能回來。由於曲速引擎嚴重受損，進取號在脈衝動力下緩緩飛向Delta Vega站。這道屏障導致了舵手加里·米切爾的變化，他開始迅速發展自己的精神力量，最終導致他喪失了自己的人性。柯克沒有接受史波克立即殺掉米切爾的建議，而是猶豫了片刻，這導致領航員Lee Kelso不幸被米切爾殺害。在Delta Vega表面，米切爾最終在Elizabeth Dehner博士的幫助下被柯克殺掉。（原初：《Where No Man Has Gone Before》）
悲劇發生後，柯克重新安排了艦橋成員。史波克中校仍然是科學官，同時也是進取號的大副；新的首席醫療官倫納德·麥考伊醫生取代了Mark Piper；蒙哥馬利·斯科特仍然是輪機長；烏乎拉上尉成為了通訊官；蘇魯田光成為了舵手。柯克在接下來的兩年裡並沒有固定的領航員。（原初：《The Corbomite Maneuver》，《Catspaw》，《Amok Time》，《Who Mourns for Adonais?》）
第二年[]
麥考伊給柯克注射藥物以治療polywater 病毒
在星曆1512.2，柯克與第一聯邦取得了第一次接觸。當時進取號被Balok艦長指揮下的Fesarius號拘留。兩位艦長都在瘋狂地虛張聲勢，柯克一直掛著撲克臉。Balok艦長最後非常友好地渴望與星際聯邦進行文化交流。（原初：《The Corbomite Maneuver》）
在星曆1533.6，進取號與一個神秘的外星文明Thasians進行了短暫的第一次接觸。柯克與進取號的來訪者查理·伊萬斯互動時，展示了高超的柔道技術。當查理的「老師」想讓他回到Thasians人身邊時，柯克表示了深切的同情。（原初：《Charlie X》）
羅慕倫指揮官
柯克在星曆1709.2擊退了已經有一個多世紀沒有與星際聯邦進行接觸的羅慕倫侵略者。羅慕倫戰艦裝備了隱形裝置和強大的等離子魚雷系統，摧毀了位於羅慕倫中立區的四個聯邦前哨站。柯克率領進取號與羅慕倫飛船交戰並展開追擊，最後羅慕倫飛船自毀。柯克和他的艦橋成員成為第一批與羅慕倫人進行視覺接觸的星際艦隊軍官，羅慕倫人向進取號的船員展示了他們的外貌。（原初：《Balance of Terror》）
進取號在星曆2712.4到達了Exo III。在那裡，Roger Korby博士在多年的研究後發現並開發了一種先進的機器人製造技術——一個早已滅亡的文明留下的遺產。Korby更換了自己受傷的身體，將自己的個性轉移到了一個機器人複製品中，並為自己打造了一個美麗的伴侶Andrea。然而機器人Korby在發瘋後，摧毀了自己。（原初：《What Are Little Girls Made Of?》）
在星曆2817.6，柯克回應了Thomas Leighton博士的呼叫。他是Tarsus IV恐怖事件中的倖存者也是目擊者。他懷疑一個巡迴演出劇組的演員Anton Karidian是「劊子手」Kodos。柯克說服了Anton Karidian的女兒Lenore將劇組帶到了進取號上。柯克和進取號工程人員Kevin Riley遭受的謀殺未遂案導柯克和Karidian（實際上是Kodos）對質，發現最近的謀殺是他的瘋女兒的所作所為，她試圖保護她飽受折磨的年邁父親。（原初：《The Conscience of the King》）
第三年[]
柯克在軍事法庭上
柯克被指控造成進取號的檔案官班傑明·芬尼的死亡後，成為第一名面臨軍事法庭審判的聯邦星艦艦長。柯克聘請了辯護律師Samuel T. Cogley，而柯克的前女友Flame Areel Shaw擔任檢察官。審判在星艦基地11號舉行。當藏在進取號上的芬尼被發現偽造自己的死亡並嫁禍給柯克時，柯克被無罪釋放。（原初：《Court Martial》）
史波克綁架了他在2267年由於一場意外已經嚴重殘廢的前任指揮官克里斯多弗·派克。史波克違抗柯克的命令，把他帶上了進取號。在史波克設定去Talos IV的航線，並強制鎖定了進取號的航向後，他決定自首，並接受軍事審判。柯克成為了審判史波克的法庭的一名成員，除了他以外，審判員還有派克和門德斯准將的假象。史波克的罪行可以判處死刑——這是聯邦法律中唯一可以判處死刑的做法。史波克的最終目的是為了讓星際艦隊出色的艦長派克在塔索斯人的假象中度過正常的生活，由於派克崇高的名望，星際艦隊決定不起訴史波克。（原初：《The Menagerie, Part I》，《The Menagerie, Part II》）
當進取號來到Omicron Delta地區時，柯克希望安排他和他的船員來一次度假。當柯克和外遣隊登陸調查一顆候選行星是否符合要求時，他們被自己看到現象的所困擾。實際上，那是一個古老文明把想法變為現實的先進技術導致的。（原初：《Shore Leave》）
在星曆2124.5，一個自稱Trelane將軍（已退休），Gothos的鄉紳的人阻撓了進取號的五年任務，柯克甚至還在虛擬法庭上被Trelane審判。儘管Trelane特別強大和難纏，但他僅僅是他種族裡的一個孩子，而且在這方面表現得很差。（原初：《The Squire of Gothos》）
柯克在星曆3045.6第一次接觸了戈恩霸權和Metrons人。柯克發現位於Cestus III的星艦基地被摧毀，星際艦隊命令進取號追擊戈恩飛船，試圖摧毀它。追擊導致兩艘飛船穿過了Metrons星域。Metrons是一個強大的和平主義文明，它終止了追擊，並聲稱星際聯邦和戈恩霸權都是野蠻人。柯克艦長和戈恩飛船艦長被強行從艦上傳送到一顆荒蕪的行星表面，Metrons人強迫兩人決鬥，威脅要摧毀失敗者的飛船。柯克最終用自製的火炮獲勝，但拒絕處決戈恩艦長。柯克的仁慈行為給Metrons人留下了深刻印象，他們讓兩艘船都獲得了自由。（原初：《Arena》）
進取號在星曆3141.9發現了一艘古代冬眠船，星艦植物灣號。這艘飛船攜帶了地球優生戰爭中的強化人，他們通過低溫保存延長生命。他們的領導人可汗·努尼恩·辛格勾引了進取號的歷史學家Marla McGivers，並喚醒了他的同伴，企圖在柯克阻止他之前奪取進取號，卻被柯克和史波克阻止。柯克讚賞可汗的能力，他決定把他和他的同伴放逐到塞蒂-阿爾法5號星。在那裡，之前的暴君可汗可以征服一整顆星球而不會傷害他人。（原初：《Space Seed》）
在星曆3192.1，進取號捲入了Eminiar VII與Vendikar的戰爭。他們的戰爭通過計算機來進行，並在公民中標記「死亡」，盡職地向死亡室匯報。當進取號被宣布為目標，船員被命令死亡後，柯克摧毀了Eminiar人的電腦，迫使他們與敵人打交道；或者面臨一場摧毀他們文明的戰爭。（原初：《A Taste of Armageddon》）
在史波克和麥考伊的陪同下，柯克在星曆3196.1於採礦殖民地Janus VI發現了已知的第一個矽基生命形式。（原初：《The Devil in the Dark》）
在聯邦和克林貢帝國之間的戰爭開始時，柯克和史波克親自會見了Organian議會，試圖說服那些表面上很落後的Organians人接受聯邦的保護。在Organia星被克林貢人占領後，柯克和史波克開始對克林貢人的占領進行游擊戰，但Organians人顯現了他們的純能量形式並進行了干預，迫使戰爭結束，並簽署了和約。Organians人預言，隨著時間的推移，敵人最終會成為朋友。諷刺的是，他們的話在一個世紀後成真了。（原初：《Errand of Mercy》）
柯克決定弄清Deneva殖民地最近與外界斷絕聯繫的原因，他發現一個蜂巢般的掠食飛行寄生蟲的幻象殺死了他的兄弟George Samuel Kirk，而殖民地的倖存者也受到了它們的影響，並導致了大規模的精神錯亂。麥考伊和史波克最終發明了一種殺死外來生物的方法。（原初：《Operation -- Annihilate!》）
在2267年，柯克最終決定讓帕維爾·契訶夫擔任進取號的領航員。
在星曆3372.7，柯克違抗星際艦隊的命令，讓進取號航向瓦肯，以避免史波克受到Pon Farr期的危險後果。在T'Pau的主持下，柯克被迫參加了史波克的婚禮，並被瘋狂的史波克「弄死」了。實際上，這是麥考伊的小把戲，把柯克用藥物弄暈，從而儘快讓柯克脫離危險。
在Halkan星上，一次傳送機的故障將進取號的外遣隊與一個鏡像宇宙的外遣隊互換。在鏡像宇宙中，沒有星際聯邦，只有野蠻、殘酷的地球帝國。鏡像柯克是帝國星艦進取號的艦長，而大副則是留著鬍子的鏡像史波克。
在一台被稱為「行星殺手」的機器幾乎摧毀了聯邦星艦星座號以後，進取號收到了星座號的緊急呼叫並改變了航線。星座號的艦長Matt Decker准將用一架穿梭機自殺式地撞擊機器後，柯克意識到足夠高的能量能炸掉那台機器，駕駛星座號撞擊了機器，並摧毀了它。
柯克、史波克和麥考伊在一顆M型行星上發現了已經失蹤了150多年的曲速引擎發明者澤弗蘭·科克倫，一種被稱為「同伴」的能量生物使他一直年輕。應科克倫的要求，柯克沒有記錄這個事件。
在拜訪聯邦科學基地Gamma Hydra IV時，來自一顆彗星的不明輻射影響了柯克和外遣隊，導致他們迅速衰老。柯克的衰老導致正在進取號上的Stocker准將解除了柯克對進取號的指揮權，直到麥考伊找到了治癒方法。柯克痊癒後，柯克再次用卡博米特從羅慕倫飛船的攻擊中脫身。
第四年[]
在星曆4523.6，進取號被派往空間站K-7。克林貢人、聯邦官員，和無數各種惱人的瑣事考驗著柯克的耐心。柯克不知道的是，班傑明·西斯科和聯邦星艦挑戰號的船員被貝久人從24世紀弄來以後，觀察並協助了他；西斯科甚至得到了柯克的簽名。（其實柯克以為他是在簽署命令。西斯科告訴柯克，能和他一起服役是他的榮幸）
柯克發現了以20世紀20年代芝加哥幫派文化為基礎的Sigma Iotia II的混亂社會，它起初讓人費解，但他很快就對它產生了興趣。柯克把各個幫派都團結在一個「老大」的領導下，Iotian成為聯邦的保護國。
柯克於星曆4211.4回到了他第一次星際艦隊任務的地點Neural。克林貢人開始向原始的土著提供武器，導致他們向鄰近的山民開戰。柯克根據最高指導原則決定向Hill人提供同樣威力的武器，這導致使衝突升級，但使雙方處於平等地位。
在進取號發現約翰·吉爾未能按時向星際艦隊報告後，柯克決定前往調查。柯克發現這裡已經變成了一個法西斯社會，成為了一個類似納粹德國的世界政府。柯克及時喚醒了被傀儡的吉爾，以避免Ekos與Zeon即將爆發的戰爭。
仙女座星系Kelvan帝國的軍官在星曆4657.5劫持了進取號，並準備回到仙女座星系。進取號經過Kelvan技術改造後，成為已知的第一艘穿越銀河系大屏障的聯邦星艦。進取號在柯克和他的高級軍官阻止Kelvan軍官並返回聯邦星域之前短暫離開了銀河系一段時間。
在星曆4842.6，進取號發現了Amerind星，在那裡，一個古老的種族，即Preservers人，擁有類似於美洲土著的文化，這些文化在過去幾個世紀裡已經瀕臨滅絕。當一次事故使柯克與外遣隊分離並導致他失憶後，史波克被迫放棄搜索，以便指揮進取號阻止一顆小行星撞擊Amerind星。幾個月來，居民們把柯克當作一個叫做Kirok的神來崇拜。在那段時間裡，柯克娶了一個妻子。在進取號返回並恢復柯克的記憶後，柯克得以激活Preservers人留下的古老行星防禦系統，從而摧毀即將到來的小行星。
柯克在星曆5027.3開始表現出奇怪的行為，並命令進取號穿過羅慕倫中立區。三艘羅慕倫戰艦扣留了進取號，柯克和斯波克在羅慕倫飛船上遇到了指揮官，史波克偽造了柯克的死。隨後，麥考伊對柯克進行了手術，這讓柯克看起來像羅慕倫人，並得以潛入羅慕倫飛船並偷走它的隱形裝置。利用這個裝置，進取號進入隱形狀態並逃往聯邦星域，還帶走了被俘的羅慕倫指揮官。整個行動的目的是得到羅慕倫人的隱形技術。如果這個行動失敗了，星際艦隊可以將責任推給柯克，而避免聯邦與羅慕倫的衝突。
在星曆5693.2，進取號來到了索利安議會的星域，並發現了聯邦星艦挑戰號。它在太空中漂浮著，機組人員全部死亡。索利安指揮官Loskene聲稱進取號侵入了索利安星域，柯克由於意外被認為已經死了。進取號與索利安人交火，同時第二艘索利安飛船加入了戰鬥，製造了一張網來禁錮進取號。在進取號的船員看到柯克的傳送影像後，經過努力，柯克成功重新回到了進取號，進取號逃脫了索利安網。
進取號於星曆5718.3訪問了Elba II的精神病院。柯克所敬仰的英雄，聯邦星艦Izar號艦長Garth得了精神病。Garth擁有細胞變形能力，並變成柯克的形態，試圖逃離精神病院並占領進取號。不過史波克最終分辨出了真正的柯克，Garth最後被送回了精神病院。
第五年[]
在星曆5843.7，一場致命的瘟疫感染了進取號的全體船員。為了治癒Holberg 917G，柯克遇到了Flint，一個近乎長生不老的人類。Flint出生於公元前4000年左右的美索不達米亞的阿克林，後來被當作所羅門、亞歷山大大帝和李奧納多·達文西，以及其他著名的歷史人物。柯克愛上了Rayna Kapec，她是一名機器人，作為在Flint隱居的最後幾天為自己打造的伴侶。一個世紀後，聯邦星艦航海家號的艦長凱薩琳·珍妮薇對這次遭遇表示了懷疑。
柯克所敬仰的的英雄——美國總統亞伯拉罕·林肯的一個令人難以置信的逼真的仿製品在星曆5906.4迎接了進取號。在Excalbia星的表面，一個矽基生命——Excalbian人重新創造了歷史人物蘇拉克、成吉思汗、Phillip Green、Kahless和Zora。柯克、史波克、林肯和蘇拉克與其他人競爭，以此來幫助Excalbian人了解善與惡的本質和力量。
在2270年，五年任務結束後，柯克命令進取號返回地球。
五年任務結束後[]
擔任星際艦隊司令[]
進取號在2270年返回地球。柯克的五年任務使他晉升為少將，並在舊金山星際艦隊總部擔任星際艦隊司令。史波克離開星際艦隊返回瓦肯，以消除所有的情感。柯克建議Will Decker取代他成為進取號艦長，而進取號在舊金山船塢進行了大規模的改裝。柯克告訴Decker，自己是多麼嫉妒他，柯克希望能再次指揮星艦。
「威者」危機[]
在22世紀70年代中期，「威者」，一種吸收（並摧毀）路徑上物質的星雲，威脅著地球。唯一一艘能夠攔截它的星際飛船是進取號。她的改裝幾乎完成，但仍在等待試航。在柯克說服Nogura上將他是應對威脅的最佳人選後，立即讓進取號起航，並在任務期間擔任艦長一職。Decker認為柯克的命令是一種侮辱和錯誤，並指出他並不熟悉該船的新系統，柯克讓Decker擔任進取號的大副。
最後，這團星雲被證明是20世紀末NASA發射的探測器旅行者6號，在漫長的旅途中積累了巨大的力量，並擁有了自我意識。當柯克和他的船員發現了威者的真面目後，並協商訪問位於威者中心的探測器時，Decker利用這個機會，在威者的保護下，通過他的情人Ilia的模擬來實現他與威者實體合併的願望。從而把威者的機械性質和Decker的人性結合起來。這種結合導致了一種全新生命形式的誕生。
這次任務成功後，柯克在22世紀70年代中後期繼續指揮進取號。柯克在2284年前的某個時候從星際艦隊退役（儘管是短暫的），以追求一些個人目標和事務，即他與一個名叫Antonia的女人的關係。
創世星事件[]
柯克於2284年回到星際艦隊，並在星艦學院中擔任指導學員的職務。在2285年，他再次登上了由史波克指揮的進取號，以指導學員。
可汗·努尼恩·辛格從他被流放的Ceti Alpha V上中逃脫，劫持了聯邦星艦信望號，並從Regula I空間站偷走了「創世裝置。卡羅爾·馬庫斯博士發出了求救信號，並被進取號接收到。進取號改變了航向。儘管柯克（有點心不在焉）一再推辭，史波克還是堅持把他的指揮權交給柯克，並調侃說，作為一個瓦肯人，「他並沒有感到挫敗感」。
接下來與可汗的戰鬥對柯克來說是一場混亂，其中包括一個幾乎災難性的失誤——他無視了薩維可引用的星際艦隊條例，這幾乎使他的飛船和船員遇難，以及與他關係不怎麼好的兒子大衛·馬庫斯的會面。進取號與可汗的戰鬥非常慘烈，史波克為了讓進取號逃脫創世裝置的影響範圍，犧牲自己，修復了曲速引擎。
柯克在2285年沉默地返回了地球，史波克的去世深深地影響了他。同時，麥考伊開始出現精神疾病的跡象。當星際艦隊指揮官Morrow上將宣布進取號將很快退役時，他的希望破滅了。
沙瑞克大使與柯克發現史波克的靈魂還活著。進取號的高級軍官聚集到柯克身邊，密謀營救被史波克的靈魂附體的麥考伊，並偷走了進取號，以便從創世星上找到史波克的屍體，並把它和他的靈魂帶到瓦肯。
在創世星，一艘克林貢猛禽艦的攻擊使進取號癱瘓。在啟動了自毀程序後，柯克和他的船員們棄船逃生到了創世星上。進取號最後和登船的倒霉克林貢人一起墜毀了。柯克發現史波克的屍體被創世星的創世能量救活，於是奪取了猛禽艦的控制權，順便把猛禽艦帶到了瓦肯。史波克的靈魂和軀體在那裡融合，他重新活了過來。
在瓦肯逃亡三個月後，柯克和他的船員們前往地球，面臨違反九項星際艦隊命令和規定的指控。在航行中，一個神秘的探測器襲擊了地球，以尋找地球鯨類滅絕的原因。在接收地球的求救信號並確定探測器此行的目標後，柯克使用引力彈弓效應將賞金號帶回到到1986年的舊金山。
在鯨類生物學家Gillian Taylor博士的幫助下，柯克成功地拯救了被捕鯨船追殺的鯨魚喬治和格雷西，並將它們帶回2286年。柯克通過從過去帶回能夠響應探測器的鯨魚，挽救了人類對鯨類捕殺導致的滅絕，並將地球從一場滅頂之災中拯救出來。
指揮聯邦星艦進取號-A[]
第一年[]
鯨魚探測器事件發生後，星際聯邦總統對柯克說：「我們永遠欠你的一份情」。鑑於他們的英勇事跡，船員們面臨的所有指控都被駁回，但仍有一項指控是針對柯克的：違反上級軍官的命令。柯克受到的懲罰是降低軍銜，他最終回到了為聯邦服務的崗位上——星際飛船司令部。2286年，他被分配到憲法（改）級星艦——聯邦星艦進取號（USS Enterprise,NCC-1701-A）上。在接下來的七年裡，他將指揮進取號-A。
經過一次短暫的試航，進取號-A故障百出。柯克、史波克和麥考伊回到了地球上的約塞米蒂國家公園度假，而蒙哥馬利·斯科特則負責解決進取號-A的技術問題。這時，史波克同父異母的兄弟賽波克組建了一支名為「銀河光明之軍」的小型暴亂部隊，接管了Nimbus III，並俘獲了聯邦、克林貢和羅慕倫的代表。
進取號-A回應了求救信號。柯克的大部分船員在賽波克心理感應的影響下，決定追隨賽波克，以滿足「上帝」。進取號-A通過了銀河系中心的大屏障，來到了傳說中的Sha Ka Ree星。可是，他們遇到的所謂「上帝」實際上是一種邪惡的能量生命形式，被囚禁並尋求釋放。賽波克犧牲了自己，以讓進取號-A逃跑。
最後一次任務[]
柯克的事業在2293年達到頂峰，當時進取號-A被派去護送克林貢總理高岡到地球參加一個和平會議。柯克反對史波克進行秘密談判的主張，他對星際艦隊選擇他來迎接克林貢人特別不滿，因為克林貢人殺死了他的兒子。克林貢帝國內部的好戰分子與進取號-A內部的間諜裡應外合，襲擊了總理的飛船，暗殺了高岡，並嫁禍給了進取號-A。
克林貢人逮捕了柯克和麥考伊，然後以謀殺高岡為罪名定罪，將他們流放到Rura Penthe星。史波克違反命令和條約，指揮進取號-A進入克林貢星域，躲過偵查，救出了柯克和麥考伊。柯克在Khitomer戰役中戰勝幕後黑手張將軍後，將聯邦總統從暗殺中解救出來，歷史性的會議繼續進行。
退休後[]
聯邦星艦進取號-B的首航[]
退休後不久，柯克和他的朋友蒙哥馬利·斯科特以及帕維爾·契訶夫一起，作為約翰·哈里曼船長的貴賓，參加了精進級星艦——聯邦星艦進取號-B的處女航。這本是一次儀式性的試航，因此進取號-B的很多系統都沒有安裝。但在出發後不久，進取號-B收到了兩艘運輸船發出的求救信號，這兩艘船隻正在運送艾奧難民，卻被困在一個叫做「時匯」的能量扭曲中。
在柯克的建議以及斯科特和契訶夫的幫助下，營救任務取得了部分成功，但進取號-B卻掉入了時匯的引力井。柯克謝絕了哈里曼給予他指揮權，前去修改了飛船的偏導儀，並成功地使飛船得以逃生，但這時，一道來自時匯的能量擊中了柯克所在的地方。柯克失蹤了，並被認為在此次任務中殉職。
離世[]
實際上，柯克在2293年進入了時匯。但由於時匯中時間的非線性，他沒有意識到已經過去了78年。聯邦星艦進取號-D艦長讓-盧克·皮卡德在時匯中發現了柯克。柯克同意離開時匯中田園詩般但並不真實的生活，以幫助皮卡德阻止企圖通過摧毀Veridian星系而進入時匯的科學怪人杜里安·索倫。
正如柯克向皮卡德解釋的那樣，他總是渴望回到進取號的艦橋，主要是因為只有在那裡柯克才能真正有所作為。他建議皮卡德拒絕星際艦隊提供的任何能讓他遠離當前事業的東西，因為他將因此失去改變自己命運的能力。
柯克犧牲了自己的生命來拯救Veridian IV星的居民以及進取號-D的機組人員，他沿著一座接近斷裂的金屬橋攀爬，以便抓住遙控器，使索倫使用的探日儀失效。柯克將遙控器成功給了皮卡德，隨後這座橋斷裂，和柯克一起墜下了懸崖。他在臨死前，確信自己有所作為後對皮卡德說：「我很樂意能夠為進取號的艦長所效勞。」柯克還對皮卡德說：「這真的是……有趣……哦……老天……」
皮卡德把柯克埋葬在一個簡單的石堆里，這個石堆位於Veridian III星的山頂上，與106年前他的朋友加里·米切爾的葬禮如出一轍。